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bcb225/Capstone-2017-1

 
 

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Introduce

2017-1 소프트웨어 종합설계 Repository
김도영, 방창배, 황현서

Subject

생물학 논문에서의 MeSH term과 Association rule을 이용하여 질병과 관련된 gene들을 찾아냄.
IMA: Identifying disease-related genes using MeSH term and Association Rule

Structure

preprocess

MeSH term을 HGNC API가 잘 읽을 수 있는 형태로 바꾸는 작업.

gene_db_server

구축한 Gene DB에 접근할 수 있는 server.

hgnc_client

HGNC API에 preprocess된 query를 보내는 client.

DB Cleaning

이전에 잘못 구현한 방식을 hotfix 형태로 수정하는 작업들.

mesh_family_processing

MeSH term 중에 Family를 나타내는 MeSH term을 알아내기 위한 작업

make_mesh_db

MeSH DB를 구축하기 위한 스크립트

weka

MeSH Term으로부터 알아낸 Gene을 대상으로 Association rule을 수행하는 스크립트

weka_analysis

Weka에서 나온 Association rule 결과를 gene relation으로 바꾸는 스크립트

About

2017-1 Capstone Project

Resources

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Releases

No releases published

Packages

No packages published

Languages

  • Python 97.0%
  • JavaScript 2.6%
  • Makefile 0.4%