diff --git a/config/clades_G_a.tsv b/config/clades_G_a.tsv index 69c5503..ccc30d7 100644 --- a/config/clades_G_a.tsv +++ b/config/clades_G_a.tsv @@ -14,34 +14,34 @@ GA2.2 G 115 P GA2.3 G 122 A GA2.3 G 156 Q -GA2.3 G 289 S -GA2.3 G 269 T +GA2.3 G 293 T +GA2.3 G 313 S -GA2.3.1 clade GA2.3 +GA2.3.1 clade GA2.3 GA2.3.1 G 254 E GA2.3.1 G 252 I -GA2.3.2 clade GA2.3 +GA2.3.2 clade GA2.3 GA2.3.2 G 133 I -GA2.3.2a clade GA2.3.2 +GA2.3.2a clade GA2.3.2 GA2.3.2a G 242 S GA2.3.2a G 225 I -GA2.3.2b clade GA2.3.2 +GA2.3.2b clade GA2.3.2 GA2.3.2b G 112 I GA2.3.2b G 141 M GA2.3.2b G 244 K -GA2.3.3 clade GA2.3 +GA2.3.3 clade GA2.3 GA2.3.3 G 111 S -GA2.3.3 G 292 S +GA2.3.3 G 316 S -GA2.3.4 clade GA2.3 +GA2.3.4 clade GA2.3 GA2.3.4 G 273 Y GA2.3.4 G 210 L -GA2.3.5 clade GA2.3 +GA2.3.5 clade GA2.3 GA2.3.5 G 232 G GA2.3.5 G 253 K @@ -55,28 +55,28 @@ GA3.0.1 G 102 F GA3.0.1 G 193 S GA3.0.1 G 295 I -GA3.0.2 clade GA3 +GA3.0.2 clade GA3 GA3.0.2 G 113 A GA3.0.2 G 125 I GA3.0.2 G 274 T -GA3.0.3 clade GA3 +GA3.0.3 clade GA3 GA3.0.3 G 161 D GA3.0.3 G 297 D -GA3.0.3a clade GA3.0.3 +GA3.0.3a clade GA3.0.3 GA3.0.3a G 232 D -GA3.0.4a clade GA3.0.3a +GA3.0.4a clade GA3.0.3a GA3.0.4a G 227 S -GA3.0.3b clade GA3.0.3 +GA3.0.3b clade GA3.0.3 -GA3.0.4b clade GA3.0.3b +GA3.0.4b clade GA3.0.3b GA3.0.4b G 219 P GA3.0.4b G 224 P GA3.0.4b G 208 Q GA3.0.4b G 246 L -GA3.0.5b clade GA3.0.4b +GA3.0.5b clade GA3.0.4b GA3.0.5b G 153 K diff --git a/config/clades_G_b.tsv b/config/clades_G_b.tsv index 8b6c53a..d92ca75 100644 --- a/config/clades_G_b.tsv +++ b/config/clades_G_b.tsv @@ -1,12 +1,12 @@ clade gene site alt GB1 G 150 S -GB1 G 280 I +GB1 G 300 I GB1 G 208 I GB1 G 222 M GB2 G 118 T GB2 G 223 T -GB2 G 257 L +GB2 G 277 L GB3 G 136 I GB3 G 71 P @@ -14,7 +14,7 @@ GB3 G 109 L GB4 G 222 A GB4 G 219 S -GB4 G 258 D +GB4 G 278 D GB5 G 143 N GB5 G 237 P @@ -22,31 +22,31 @@ GB5 G 237 P GB5.0.0 G 143 N GB5.0.0 G 237 P -GB5.0.1 clade GB5 +GB5.0.1 clade GB5 GB5.0.1 G 247 P -GB5.0.2 clade GB5.0.1 +GB5.0.2 clade GB5.0.1 GB5.0.2 G 223 P GB5.0.2 G 138 S -GB5.0.3 clade GB5.0.2 -GB5.0.3 G 269 A +GB5.0.3 clade GB5.0.2 +GB5.0.3 G 289 A -GB5.0.4a G 282 T +GB5.0.4a G 302 T GB5.0.4a G 200 T -GB5.0.5a clade GB5.0.0 +GB5.0.5a clade GB5.0.0 GB5.0.5a G 136 T GB5.0.4b G 153 R -GB5.0.4b G 266 L +GB5.0.4b G 286 L -GB5.0.4c clade GB5.0.3 -GB5.0.4c G 285 D +GB5.0.4c clade GB5.0.3 +GB5.0.4c G 305 D GB7 G 242 K GB7 G 214 I GB6 G 235 L GB6 G 126 K -GB6 G 262 P +GB6 G 282 P