From f7452896709de1bfc9e042806736e7db84b7faa9 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Stefan Janssen Date: Mon, 26 Apr 2021 22:49:31 +0200 Subject: [PATCH] updated truth after checking against ViennaRNA 2.4.17 --- Truth/Regress/adpf.mfepp.foo.out | 33 ++++++++++--------- Truth/Regress/adpf.mfepp.windowkbacktrack.out | 24 +++++++------- 2 files changed, 29 insertions(+), 28 deletions(-) diff --git a/Truth/Regress/adpf.mfepp.foo.out b/Truth/Regress/adpf.mfepp.foo.out index 65c6bf1a..2ae2235d 100644 --- a/Truth/Regress/adpf.mfepp.foo.out +++ b/Truth/Regress/adpf.mfepp.foo.out @@ -1,6 +1,6 @@ Answer (0, 100) : -( -2950 , ..........(((((((((((((............(((((((.((...((((((...((......))..)))))).)).)))))))))))))).)))))) ) -( -2950 , ..........(((((((((((((............(((((((.((...((((((...((......))..)))))).)).))))))))))))))).))))) ) +( -2840 , ..........(((((((((((((............(((((((.((...((((((...((......))..)))))).)).)))))))))))))).)))))) ) +( -2840 , ..........(((((((((((((............(((((((.((...((((((...((......))..)))))).)).))))))))))))))).))))) ) Answer (50, 150) : ( -3150 , .((((((((((.......))))).))).....((((((..(((.....))).))))))))(((((((.((((..(((....)))..)))))))))))... ) @@ -15,10 +15,10 @@ Answer (200, 300) : ( -3070 , .((((((..((((((..((((....))))..)))))).))))))...(((........)))(((.(((.((...(((((......))))).)))))))). ) Answer (250, 350) : -( -2740 , ((((((((...(((.((.((((..(((((......)))))(((((...((((....))))..)))))........))))..)).))).))).)))))... ) +( -2710 , ((((((((...(((.((.((((..(((((......)))))(((((...((((....))))..)))))........))))..)).))).))).)))))... ) Answer (300, 400) : -( -2092 , .......(((..((((..........((((........))))(((((((...)))))))((.((((((((.............))))))))))))))))) ) +( -2032 , .......(((..((((..........((((........))))(((((((...)))))))((.((((((((.............))))))))))))))))) ) Answer (350, 450) : ( -3330 , ............((((((.((((...........((((((((((..(((......))).))))))))))((....))............)))))))))). ) @@ -29,7 +29,7 @@ Answer (400, 500) : ( -2340 , ...((((((((((.....)))).((((......(((((........))))).(((((((.((.((......))...)).))))).)))))).))).))). ) Answer (450, 550) : -( -2990 , ..(((..(((.((((...)))).)))..........(((((((....(((((..(((.(((.(((.....)))))).)))))))).)))))))....))) ) +( -2950 , ..(((..(((.((((...)))).)))..........(((((((....(((((..(((.(((.(((.....)))))).)))))))).)))))))....))) ) Answer (500, 600) : ( -2490 , (((((((.(((.(((.....)))))).))))).))..(((....((..((((.(((((((((((.....)))..)).))))))))))..))...)))... ) @@ -37,12 +37,10 @@ Answer (500, 600) : ( -2490 , (((((((.(((.(((.....)))))).))))).))..(((....((..((((.(((((((((((.....)))..)))).))))))))..))...)))... ) Answer (550, 650) : -( -1750 , ...(((((((((((.....)))..)).))))))...........((((.....((((((((((((.....)))))).........)))))).....)))) ) -( -1750 , 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-( -3130 , .((((((.(((((((...(((.((....)).)))(((...))).)))))))))))...)).(((((.(((((((((.......))))).)).)).))))) ) -( -3130 , .(((((.((((((((...(((..........)))(((...))).)))))))))))...)).(((((.(((((((((.......))))).)).)).))))) ) -( -3130 , .(((((.((((((((...(((.((....)).)))(((...))).)))))))))))...)).(((((.(((((((((.......))))).)).)).))))) ) +( -3000 , .((((((.(((((((...(((..........)))(((...))).)))))))))))...)).(((((.(((((((((.......))))).)).)).))))) ) +( -3000 , .((((((.(((((((...(((.((....)).)))(((...))).)))))))))))...)).(((((.(((((((((.......))))).)).)).))))) ) +( -3000 , .(((((.((((((((...(((..........)))(((...))).)))))))))))...)).(((((.(((((((((.......))))).)).)).))))) ) +( -3000 , .(((((.((((((((...(((.((....)).)))(((...))).)))))))))))...)).(((((.(((((((((.......))))).)).)).))))) ) Answer (800, 900) : -( -2720 , ..((....((.(((((.(((((((((.......))))).)).)).)))))))..((..((((((..((((...))))..)).))))...)).......)) ) +( -2560 , ..((....((.(((((.(((((((((.......))))).)).)).))))))).(((.....)))......................))(((.....))). ) Answer (850, 950) : -( -2580 , ...(((.....))).......(((..(((((((...(((.((......)).)))......(((((....)))))......))))))).((.....))))) ) +( -2510 , ...(((.....(((......)))............((((((.....(((((..((.....(((((....))))).))..)))))....))).)))))).. ) Answer (900, 1000) : -( -3010 , (((((.....(((((....)))))..(((........)))((((.((.....))((((.((.((.....)).)))))).)))).)))))........... ) +( -3000 , ..((......(((((....)))))......((((....(((.((.......)))))))))..))....((((((((((......))))))..)))).... ) +( -3000 , ..((......(((((....)))))......((((....(((.((.......)))))))))..))....((((((((((......)))))))..))).... ) +( -3000 , ..((......(((((....)))))......((((....(((.((.......)))))))))..)).((..(((.(((((......))))))))..)).... ) +( -3000 , ..((......(((((....)))))......((((....(((.((.......)))))))))..)).((..((.((((((......))))))))..)).... ) diff --git a/Truth/Regress/adpf.mfepp.windowkbacktrack.out b/Truth/Regress/adpf.mfepp.windowkbacktrack.out index 32957ca2..e2a20b48 100644 --- a/Truth/Regress/adpf.mfepp.windowkbacktrack.out +++ b/Truth/Regress/adpf.mfepp.windowkbacktrack.out @@ -7,25 +7,25 @@ Answer (2, 22) : Answer (3, 23) : ( 0 , .................... ) Answer (4, 24) : -( -20 , ((..((((....))))..)) ) +( 0 , .................... ) Answer (5, 25) : ( 0 , .................... ) Answer (6, 26) : -( -70 , ....((((........)))) ) +( 0 , .................... ) Answer (7, 27) : -( -300 , ..(((((........))))) ) +( -170 , ..(((((........))))) ) Answer (8, 28) : -( -340 , ((((((........)))))) ) +( -300 , .(((((........))))). ) Answer (9, 29) : -( -300 , (((((........))))).. ) +( -290 , (((((........))))).. ) Answer (10, 30) : -( -70 , ((((........)))).... ) +( -40 , ((((........)))).... ) Answer (11, 31) : ( 0 , .................... ) Answer (12, 32) : -( -120 , .......(((.......))) ) +( 0 , .................... ) Answer (13, 33) : -( -140 , ............((....)) ) +( -120 , 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