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#!/usr/bin/env python
# Author: Chris Jackson 2020
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Additional information:
Filters the mega353.fasta file based on a user-provided select file. Retains all sequences from the original 353
target file.
Please ensure that the working directory contains a select file (e.g. 'select.txt' ).
An example select file:
[Target_name]
QUTB
YHFG
WFBF
HAEU
[Group]
Basalmost angiosperms
[Order]
Chloranthales
[Family]
[Species]
NOTE: not all 'levels' in the select file need to be specified. A non-redundant list of 'Target_name' four-letter codes
will be used to select sequences for the filtered bait file.
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"""
import logging
import sys
import argparse
import os
import socket
import re
import itertools
try:
import pandas as pd
except ImportError:
sys.exit(f"Required Python package 'pandas' not found. Is it installed for the Python used to run this script?")
try:
from Bio import SeqIO
except ImportError:
sys.exit(f"Required Python package 'Bio' not found. Is it installed for the Python used to run this script?")
import fnmatch
if sys.version_info[0:2] < (3, 7):
sys.exit(
f'Must be using Python 3.7 or higher. You are using version {sys.version_info[0]}.{sys.version_info[1]}. '
f'You could try running the script in a conda environment with version 3.7 installed...')
########################################################################################################################
########################################################################################################################
# List of target names for filtering
Target_name = ['QUTB', 'HAEU', 'IWMW', 'EHNF', 'OKEF', 'XMQO', 'FAKD', 'VQFW', 'GRRW', 'SIIK', 'RQUG', 'AALA', 'YHFG',
'WFBF', 'QTJY', 'NMGG', 'CCID', 'LVNW', 'IRAF', 'AUGV', 'UDHA', 'XMVD', 'ZGQD', 'EVOD', 'SSDU', 'BEKN',
'QCOU', 'RQNK', 'XHKT', 'ZUHO', 'UPOG', 'Aquco', 'CYVA', 'VGHH', 'GBVZ', 'SWOH', 'URDJ', 'Ambtr', 'FZJL',
'VZCI', 'ROAP', 'NWMY', 'NPND', 'WTKZ', 'PZRT', 'WZFE', 'OSHQ', 'GJNX', 'BJKT', 'HZTS', 'EDIT', 'OMYK',
'BERS', 'PDQH', 'HDSY', 'ZBPY', 'OHKC', 'BWRK', 'EYRD', 'XSSD', 'WMLW', 'FVXD', 'CUTE', 'SMMC', 'WGET',
'CTYH', 'CPKP', 'QAIR', 'JLOV', 'SHEZ', 'RXEN', 'SKNL', 'OLES', 'FZQN', 'TJES', 'ONLQ', 'AAXJ', 'CBJR',
'WPYJ', 'YNFJ', 'RNBN', 'SCAO', 'NXTS', 'WQUF', 'HMFE', 'DVXD', 'EGOS', 'ZBTA', 'VJPU', 'JAFJ', 'JGAB',
'AZBL', 'RUUB', 'SFKQ', 'BKQU', 'MRKX', 'WOBD', 'CGGO', 'FYSJ', 'LDEL', 'LLQV', 'CPLT', 'UQCB', 'EZGR',
'IWIS', 'GCYL', 'BYNZ', 'KDCH', 'GIWN', 'CVDF', 'LKKX', 'HTDC', 'STKY', 'VGVI', 'XKPS', 'BSEY', 'XGFU',
'RSPO', 'QKMG', 'LMVB', 'TOKV', 'NUZN', 'KWGC', 'DRIL', 'ZJUL', 'FYTP', 'SYHW', 'IUSR', 'YKQR', 'TQOO',
'OMDH', 'HQRJ', 'UWFU', 'HTIP', 'CKKR', 'CIAC', 'OOVX', 'ERIA', 'DAYQ', 'UHBY', 'YKFU', 'FCBJ', 'CTSS',
'SLOI', 'TQKZ', 'CWYJ', 'SUVN', 'OINM', 'EDBB', 'MVSE', 'QIKZ', 'WEQK', 'AJFN', 'SBZH', 'SALZ', 'NTEO',
'SXML', 'DFYF', 'ASMV', 'QACK', 'GIOY', 'GUMF', 'XRCX', 'CFRN', 'JNKW', 'MHYG', 'DESP', 'YRBQ', 'JEPE',
'JYMN', 'BIDT', 'QXWF', 'NVSO', 'AQZD', 'LYPZ', 'UYED', 'ZCUA', 'HXCD', 'DUNJ', 'AFQQ', 'RFSD', 'DOVJ',
'OAGK', 'BMSE', 'EYKJ', 'TEZA', 'DUQG', 'KFZY', 'DDRL', 'KGJF', 'FUPX', 'UBLN', 'IZLO', 'IHPC', 'HUQC',
'IXVJ', 'AUIP', 'FXGI', 'EMAL', 'XVRU', 'OUER', 'OEKO', 'ABEH', 'NIGS', 'MZOB', 'IDGE', 'DIHD', 'JWEY',
'MDJK', 'SMUR', 'DKFZ', 'YQIJ', 'HANM', 'FWBF', 'BFJL', 'UZNH', 'OTAN', 'QURC', 'ZETY', 'BTZX', 'VTLJ',
'XONJ', 'VUSY', 'ZJRC', 'HLJG', 'GSZA', 'CAQZ', 'FFFY', 'JTRM', 'QAUE', 'JEXA', 'YZGX', 'PIYM', 'ADHK',
'UFHF', 'KVFU', 'AVJK', 'WXVX', 'LRTN', 'PPPZ', 'SERM', 'YSRZ', 'VKJD', 'BNTL', 'ODDO', 'DAAD', 'NGRR',
'WVMY', 'FNEN', 'HUSX', 'BEFC', 'OXYP', 'WRPP', 'AXBO', 'JPDJ', 'PTFA', 'CLMX', 'TPEM', 'SZUO', 'GIPR',
'MGVU', 'YFQX', 'JCLQ', 'DSUV', 'YADI', 'UOYN', 'JGYZ', 'QEHE', 'EDEQ', 'HGSM', 'KPUM', 'ECTD', 'GGJD',
'WQRD', 'ULGV', 'ZSGF', 'PCNH', 'QZZU', 'PVGM', 'PCGJ', 'AYIY', 'NBMW', 'WEAC', 'XAYK', 'TKEK', 'UTQR',
'GDZS', 'DCCI', 'RWKR', 'DTNC', 'PUCW', 'UCNM', 'FYUH', 'SNNC', 'EAAA', 'TAGM', 'WHNV', 'FUMQ', 'GNPX',
'RTNA', 'GETL', 'XMBA', 'PHCE', 'DYFF', 'FDMM', 'EQDA', 'ATYL', 'BAHE', 'LRRR', 'IYDF', 'DMLT', 'MXFG',
'JCMU', 'HRUR', 'KTAR', 'UEEN', 'MZLD', 'TORX', 'FAMO', 'FROP', 'EJCM', 'VYDM', 'UMUL', 'ZRIN', 'Mimgu',
'XISJ', 'CLRW', 'GNRI', 'YKZB', 'PTBJ', 'OWAS', 'WOHL', 'EDXZ', 'EJBY', 'XRLM', 'GRFT', 'SIBR', 'XXYA',
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'Solly', 'DLJZ', 'NMDZ', 'LQJY', 'HYZL', 'DZTK', 'Arath', 'TZWR', 'IPWB', 'CSUV', 'HABV', 'GTSV', 'UVQL',
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'Aquifoliales', 'Aquifoliales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales',
'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales',
'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales',
'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales',
'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales', 'Asterales',
'Boraginales', 'Boraginales', 'Boraginales', 'Boraginales', 'Boraginales', 'Boraginales', 'Boraginales',
'Boraginales', 'Boraginales', 'Boraginales', 'Boraginales', 'Boraginales', 'Boraginales', 'Boraginales',
'Boraginales', 'Cornales', 'Cornales', 'Cornales', 'Cornales', 'Cornales', 'Cornales', 'Cornales', 'Cornales',
'Cornales', 'Cornales', 'Dipsacales', 'Dipsacales', 'Dipsacales', 'Dipsacales', 'Dipsacales', 'Dispsacales',
'Ericales', 'Ericales', 'Ericales', 'Ericales', 'Ericales', 'Ericales', 'Ericales', 'Ericales', 'Ericales',
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'Ericales', 'Ericales', 'Ericales', 'Ericales', 'Ericales', 'Ericales', 'Ericales', 'Ericales', 'Ericales',
'Escalloniales', 'Escalloniales', 'Garryales', 'Garryales', 'Gentianales', 'Gentianales', 'Gentianales',
'Gentianales', 'Gentianales', 'Gentianales', 'Gentianales', 'Gentianales', 'Gentianales', 'Gentianales',
'Gentianales', 'Gentianales', 'Gentianales', 'Gentianales', 'Gentianales', 'Gentianales', 'Gentianales',
'Icacinales', 'Icacinales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales',
'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales',
'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales',
'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales',
'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales',
'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales',
'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales', 'Lamiales',
'Lamiales', 'Lamiales', 'Solanales', 'Solanales', 'Solanales', 'Solanales', 'Solanales', 'Solanales',
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'Solanales', 'Solanales', 'Solanales', 'Solanales', 'Solanales', 'Solanales', 'Solanales', 'Solanales',
'Solanales', 'Solanales', 'Solanales', 'Solanales', 'Brassicales', 'Brassicales', 'Brassicales', 'Brassicales',
'Brassicales', 'Brassicales', 'Brassicales', 'Brassicales', 'Brassicales', 'Brassicales', 'Brassicales',
'Brassicales', 'Brassicales', 'Brassicales', 'Brassicales', 'Brassicales', 'Brassicales', 'Brassicales',
'Brassicales', 'Brassicales', 'Brassicales', 'Brassicales', 'Brassicales', 'Brassicales', 'Celastrales',
'Celastrales', 'Crossosomatales', 'Crossosomatales', 'Cucurbitales', 'Cucurbitales', 'Cucurbitales',
'Cucurbitales', 'Fabales', 'Fabales', 'Fabales', 'Fabales', 'Fabales', 'Fabales', 'Fabales', 'Fabales',
'Fabales', 'Fabales', 'Fabales', 'Fabales', 'Fabales', 'Fabales', 'Fabales', 'Fabales', 'Fabales', 'Fabales',
'Fabales', 'Fabales', 'Fabales', 'Fabales', 'Fabales', 'Fabales', 'Fabales', 'Fabales', 'Fabales', 'Fagales',
'Fagales', 'Fagales', 'Fagales', 'Fagales', 'Fagales', 'Fagales', 'Fagales', 'Fagales', 'Fagales', 'Fagales',
'Geraniales', 'Geraniales', 'Geraniales', 'Huerteales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales',
'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales',
'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales',
'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales',
'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales',
'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales',
'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malpighiales', 'Malvales', 'Malvales', 'Malvales', 'Malvales',
'Malvales', 'Malvales', 'Malvales', 'Malvales', 'Malvales', 'Malvales', 'Malvales', 'Myrtales', 'Myrtales',
'Myrtales', 'Myrtales', 'Myrtales', 'Myrtales', 'Myrtales', 'Myrtales', 'Myrtales', 'Myrtales', 'Myrtales',
'Myrtales', 'Myrtales', 'Myrtales', 'Myrtales', 'Myrtales', 'Myrtales', 'Myrtales', 'Myrtales', 'Myrtales',
'Myrtales', 'Myrtales', 'Myrtales', 'Myrtales', 'Myrtales', 'Myrtales', 'Myrtales', 'Myrtales', 'Myrtales',
'Myrtales', 'Myrtales', 'Oxalidales', 'Oxalidales', 'Oxalidales', 'Oxalidales', 'Rosales', 'Rosales',
'Rosales', 'Rosales', 'Rosales', 'Rosales', 'Rosales', 'Rosales', 'Rosales', 'Rosales', 'Rosales', 'Rosales',
'Rosales', 'Rosales', 'Rosales', 'Rosales', 'Rosales', 'Rosales', 'Rosales', 'Rosales', 'Rosales', 'Rosales',
'Rosales', 'Rosales', 'Rosales', 'Rosales', 'Sapindales', 'Sapindales', 'Sapindales', 'Sapindales',
'Sapindales', 'Sapindales', 'Sapindales', 'Sapindales', 'Sapindales', 'Sapindales', 'Sapindales', 'Sapindales',
'Sapindales', 'Sapindales', 'Vitales', 'Vitales', 'Vitales', 'Vitales', 'Zygophyllales', 'Zygophyllales',
'Zygophyllales', 'Canellales', 'Canellales', 'Laurales', 'Laurales', 'Laurales', 'Laurales', 'Laurales',
'Laurales', 'Laurales', 'Laurales', 'Laurales', 'Laurales', 'Laurales', 'Magnoliales', 'Magnoliales',
'Magnoliales', 'Magnoliales', 'Magnoliales', 'Magnoliales', 'Piperales', 'Piperales', 'Piperales', 'Piperales',
'Piperales', 'Piperales', 'Acorales', 'Alismatales', 'Alismatales', 'Alismatales', 'Alismatales',
'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales',
'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales',
'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales',
'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales',
'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales',
'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales',
'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Asparagales', 'Dioscoreales', 'Liliales', 'Liliales', 'Liliales',
'Liliales', 'Liliales', 'Liliales', 'Pandanales', 'Pandanales', 'Pandanales', 'Pandanales', 'Pandanales',
'Arecales', 'Arecales', 'Arecales', 'Arecales', 'Arecales', 'Poales', 'Poales', 'Poales', 'Poales', 'Poales',
'Poales', 'Poales', 'Poales', 'Poales', 'Poales', 'Poales', 'Poales', 'Poales', 'Poales', 'Poales', 'Poales',
'Poales', 'Poales', 'Poales', 'Poales', 'Poales', 'Poales', 'Poales', 'Poales', 'Poales', 'Poales', 'Poales',
'Poales', 'Poales', 'Poales', 'Zingiberales', 'Zingiberales', 'Zingiberales', 'Zingiberales', 'Zingiberales',
'Zingiberales', 'Zingiberales']
# list of Family names for filtering
Family = ['Aextoxicaceae', 'Berberidopsidaceae', 'Buxaceae', 'Dilleniaceae', 'Dilleniaceae', 'Gunneraceae',
'Nelumbonaceae', 'Platanaceae', 'Proteaceae', 'Proteaceae', 'Proteaceae', 'Sabiaceae', 'Berberidaceae',
'Berberidaceae', 'Eupteleaceae', 'Fumariaceae', 'Lardizabalaceae', 'Menispermaceae', 'Papaveraceae',
'Papaveraceae', 'Papaveraceae', 'Papaveraceae', 'Papaveraceae', 'Papaveraceae', 'Papaveraceae',
'Papaveraceae', 'Papaveraceae', 'Papaveraceae', 'Papaveraceae', 'Ranunculaceae', 'Ranunculaceae',
'Ranunculaceae', 'Ranunculaceae', 'Ranunculaceae', 'Ranunculaceae', 'Trochodendraceae', 'Amborellaceae',
'Amborellaceae', 'Austrobaileyaceae', 'Schisandraceae', 'Schisandraceae', 'Schisandraceae',
'Ceratophyllaceae', 'Nymphaeaceae', 'Nymphaeaceae', 'Chloranthaceae', 'Chloranthaceae', 'Aizoaceae',
'Aizoaceae', 'Aizoaceae', 'Aizoaceae', 'Aizoaceae', 'Aizoaceae', 'Amaranthaceae', 'Amaranthaceae',
'Amaranthaceae', 'Amaranthaceae', 'Amaranthaceae', 'Amaranthaceae', 'Amaranthaceae', 'Amaranthaceae',
'Amaranthaceae', 'Amaranthaceae', 'Amaranthaceae', 'Amaranthaceae', 'Basellaceae', 'Cactaceae', 'Cactaceae',
'Cactaceae', 'Caryophyllaceae', 'Caryophyllaceae', 'Caryophyllaceae', 'Caryophyllaceae', 'Caryophyllaceae',
'Caryophyllaceae', 'Chenopodiaceae', 'Chenopodiaceae', 'Chenopodiaceae', 'Frankeniaceae', 'Miroteaceae',
'Molluginaceae', 'Molluginaceae', 'Molluginaceae', 'Nepenthaceae', 'Nyctaginaceae', 'Nyctaginaceae',
'Nyctaginaceae', 'Nyctaginaceae', 'Nyctaginaceae', 'Nyctaginaceae', 'Nyctaginaceae', 'Petiveriaceae',
'Physenaceae', 'Phytolaccaceae', 'Phytolaccaceae', 'Phytolaccaceae', 'Plumbaginaceae', 'Plumbaginaceae',
'Polygonaceae', 'Portulacaceae', 'Portulacaceae', 'Portulacaceae', 'Portulacaceae', 'Portulacaceae',
'Portulacaceae', 'Portulacaceae', 'Portulacaceae', 'Portulacaceae', 'Sarcobataceae', 'Simmondsiaceae',
'Talinaceae', 'Tamaricaceae', 'Balanophoraceae', 'Loranthaceae', 'Olacaceae', 'Santalaceae', 'Santalaceae',
'Santalaceae', 'Viscaceae', 'Altingiaceae', 'Aphanopetalaceae', 'Cercidiphyllaceae', 'Crassulaceae',
'Crassulaceae', 'Crassulaceae', 'Daphniphyllaceae', 'Grossulariaceae', 'Haloragaceae', 'Hamamelidaceae',
'Hamamelidaceae', 'Hamamelidaceae', 'Hamamelidaceae', 'Iteaceae', 'Paeoniaceae', 'Saxifragaceae',
'Saxifragaceae', 'Saxifragaceae', 'Saxifragaceae', 'Saxifragaceae', 'Saxifragaceae', 'Saxifragaceae',
'Saxifragaceae', 'Saxifragaceae', 'Saxifragaceae', 'Apiaceae', 'Apiaceae', 'Araliaceae', 'Araliaceae',
'Araliaceae', 'Griseliniaceae', 'Griseliniaceae', 'Mackinlayaceae', 'Myodocarpaceae', 'Pennantiaceae',
'Pittosporaceae', 'Pittosporaceae', 'Aquifoliaceae', 'Aquifoliaceae', 'Aquifoliaceae', 'Helwingiaceae',
'Argophyllaceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae',
'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae',
'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae',
'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae',
'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Asteraceae', 'Campanulaceae', 'Campanulaceae', 'Goodeniaceae',
'Menyanthaceae', 'Phellinaceae', 'Stylidiaceae', 'Boraginaceae', 'Boraginaceae', 'Boraginaceae',
'Boraginaceae', 'Boraginaceae', 'Boraginaceae', 'Boraginaceae', 'Boraginaceae', 'Boraginaceae',
'Boraginaceae', 'Boraginaceae', 'Boraginaceae', 'Boraginaceae', 'Boraginaceae', 'Boraginaceae', 'Alangiaceae',
'Cornaceae', 'Curtisiaceae', 'Hydrangeaceae', 'Hydrangeaceae', 'Hydrangeaceae', 'Hydrangeaceae', 'Loasaceae',
'Nyssaceae', 'Nyssaceae', 'Adoxaceae', 'Adoxaceae', 'Caprifoliaceae', 'Caprifoliaceae', 'Valerianaceae',
'Dipsacaceae', 'Actinidiaceae', 'Balsaminaceae', 'Cyrillaceae', 'Diapensiaceae', 'Diapensiaceae',
'Diapensiaceae', 'Ebenaceae', 'Ericaceae', 'Ericaceae', 'Ericaceae', 'Ericaceae', 'Ericaceae',
'Fouquieriaceae', 'Maesaceae', 'Marcgraviaceae', 'Myrsinaceae', 'Myrsinaceae', 'Pentaphylacaceae',
'Polemoniaceae', 'Polemoniaceae', 'Roridulaceae', 'Sapotaceae', 'Sapotaceae', 'Sapotaceae', 'Styracaceae',
'Symplocaceae', 'Theophrastaceae', 'Escalloniaceae', 'Escalloniaceae', 'Eucommiaceae', 'Garryaceae',
'Apocynaceae', 'Apocynaceae', 'Apocynaceae', 'Apocynaceae', 'Apocynaceae', 'Apocynaceae', 'Apocynaceae',
'Apocynaceae', 'Apocynaceae', 'Gelsemiaceae', 'Gentianaceae', 'Gentianaceae', 'Loganiaceae', 'Rubiaceae',
'Rubiaceae', 'Rubiaceae', 'Rubiaceae', 'Icacinaceae', 'Oncothecaceae', 'Acanthaceae', 'Acanthaceae',
'Acanthaceae', 'Acanthaceae', 'Bignoniaceae', 'Bignoniaceae', 'Bignoniaceae', 'Byblidaceae',
'Calceolariaceae', 'Gesneriaceae', 'Gesneriaceae', 'Lamiaceae', 'Lamiaceae', 'Lamiaceae', 'Lamiaceae',
'Lamiaceae', 'Lamiaceae', 'Lamiaceae', 'Lamiaceae', 'Lamiaceae', 'Lamiaceae', 'Lamiaceae', 'Lamiaceae',
'Lamiaceae', 'Lamiaceae', 'Lamiaceae', 'Lamiaceae', 'Lamiaceae', 'Lamiaceae', 'Lamiaceae', 'Lamiaceae',
'Lamiaceae', 'Lentibulariaceae', 'Lentibulariaceae', 'Lentibulariaceae', 'Oleaceae', 'Oleaceae', 'Oleaceae',
'Oleaceae', 'Orobanchaceae', 'Orobanchaceae', 'Orobanchaceae', 'Orobanchaceae', 'Paulowniaceae',
'Pedaliaceae', 'Phrymaceae', 'Plantaginaceae', 'Plantaginaceae', 'Plantaginaceae', 'Plantaginaceae',
'Plantaginaceae', 'Rehmnniaceae', 'Schlegeliaceae', 'Schlegeliaceae', 'Scrophulariaceae', 'Scrophulariaceae',
'Scrophulariaceae', 'Scrophulariaceae', 'Scrophulariaceae', 'Tetrachondraceae', 'Verbenaceae', 'Verbenaceae',
'Verbenaceae', 'Convolvulaceae', 'Convolvulaceae', 'Convolvulaceae', 'Convolvulaceae', 'Convolvulaceae',
'Convolvulaceae', 'Convolvulaceae', 'Convolvulaceae', 'Convolvulaceae', 'Convolvulaceae', 'Convolvulaceae',
'Convolvulaceae', 'Montiniaceae', 'Solanaceae', 'Solanaceae', 'Solanaceae', 'Solanaceae', 'Solanaceae',
'Solanaceae', 'Solanaceae', 'Solanaceae', 'Solanaceae', 'Solanaceae', 'Solanaceae', 'Solanaceae',
'Solanaceae', 'Akaniaceae', 'Bataceae', 'Brassicaceae', 'Brassicaceae', 'Brassicaceae', 'Brassicaceae',
'Brassicaceae', 'Brassicaceae', 'Brassicaceae', 'Brassicaceae', 'Brassicaceae', 'Brassicaceae',
'Brassicaceae', 'Caricaceae', 'Cleomaceae', 'Cleomaceae', 'Cleomaceae', 'Cleomaceae', 'Koeberliniaceae',
'Limnanthaceae', 'Moringaceae', 'Resedaceae', 'Salvadoraceae', 'Tropaeolaceae', 'Celastraceae',
'Celastraceae', 'Stachyuraceae', 'Staphyleaceae', 'Apodanthaceae', 'Begoniaceae', 'Coriariaceae',
'Cucurbitaceae', 'Fabaceae', 'Fabaceae', 'Fabaceae', 'Fabaceae', 'Fabaceae', 'Fabaceae', 'Fabaceae',
'Fabaceae', 'Fabaceae', 'Fabaceae', 'Fabaceae', 'Fabaceae', 'Fabaceae', 'Fabaceae', 'Fabaceae', 'Fabaceae',
'Fabaceae', 'Fabaceae', 'Fabaceae', 'Fabaceae', 'Fabaceae', 'Fabaceae', 'Fabaceae', 'Fabaceae', 'Fabaceae',
'Polygalaceae', 'Quillajaceae', 'Betulaceae', 'Betulaceae', 'Casuarinaceae', 'Fagaceae', 'Fagaceae',
'Fagaceae', 'Fagaceae', 'Juglandaceae', 'Juglandaceae', 'Myricaceae', 'Nothofagaceae', 'Geraniaceae',
'Melianthaceae', 'Melianthaceae', 'Tapisciaceae', 'Calophyllaceae', 'Chrysobalanaceae', 'Chrysobalanaceae',
'Clusiaceae', 'Clusiaceae', 'Erythroyxlaceae', 'Euphorbiaceae', 'Euphorbiaceae', 'Euphorbiaceae',
'Euphorbiaceae', 'Euphorbiaceae', 'Euphorbiaceae', 'Hypericaceae', 'Linaceae', 'Linaceae', 'Linaceae',
'Linaceae', 'Linaceae', 'Linaceae', 'Linaceae', 'Linaceae', 'Linaceae', 'Malesherbiaceae', 'Malpighiaceae',
'Ochnaceae', 'Ochnaceae', 'Passifloraceae', 'Passifloraceae', 'Phyllanthaceae', 'Phyllanthaceae',
'Putranjivaceae', 'Rhizophoraceae', 'Salicaceae', 'Salicaceae', 'Salicaceae', 'Salicaceae', 'Salicaceae',
'Salicaceae', 'Salicaceae', 'Salicaceae', 'Violaceae', 'Violaceae', 'Bixaceae', 'Cistaceae', 'Malvaceae',
'Malvaceae', 'Malvaceae', 'Malvaceae', 'Muntingiaceae', 'Sarcolaenaceae', 'Thymelaeaceae', 'Thymelaeaceae',
'Thymelaeaceae', 'Combretaceae', 'Gyrostemonaceae', 'Heteropyxidaceae', 'Lythraceae', 'Lythraceae',
'Melastomataceae', 'Melastomataceae', 'Myrtaceae', 'Myrtaceae', 'Myrtaceae', 'Myrtaceae', 'Myrtaceae',
'Onagraceae', 'Onagraceae', 'Onagraceae', 'Onagraceae', 'Onagraceae', 'Onagraceae', 'Onagraceae',
'Onagraceae', 'Onagraceae', 'Onagraceae', 'Onagraceae', 'Onagraceae', 'Onagraceae', 'Onagraceae',
'Onagraceae', 'Onagraceae', 'Onagraceae', 'Onagraceae', 'Onagraceae', 'Cephalotaceae', 'Cunoniaceae',
'Elaeocarpaceae', 'Oxalidaceae', 'Cannabaceae', 'Cannabaceae', 'Cannabaceae', 'Elaeagnaceae', 'Moraceae',
'Moraceae', 'Rhamnaceae', 'Rhamnaceae', 'Rhamnaceae', 'Rosaceae', 'Rosaceae', 'Rosaceae', 'Rosaceae',
'Rosaceae', 'Rosaceae', 'Rosaceae', 'Rosaceae', 'Rosaceae', 'Rosaceae', 'Rosaceae', 'Rosaceae', 'Rosaceae',
'Rosaceae', 'Ulmaceae', 'Urticaceae', 'Urticaceae', 'Anacardiaceae', 'Anacardiaceae', 'Burseraceae',
'Burseraceae', 'Kirkiaceae', 'Meliaceae', 'Meliaceae', 'Nitrariaceae', 'Rutaceae', 'Rutaceae', 'Sapindaceae',
'Sapindaceae', 'Simaroubaceae', 'Simaroubaceae', 'Vitaceae', 'Vitaceae', 'Vitaceae', 'Vitaceae',
'Krameriaceae', 'Zygophyllaceae', 'Zygophyllaceae', 'Canellaceae', 'Winteraceae', 'Atherospermataceae',
'Calycanthaceae', 'Calycanthaceae', 'Gomortegaceae', 'Hernandiaceae', 'Lauraceae', 'Lauraceae', 'Lauraceae',
'Lauraceae', 'Lauraceae', 'Monimiaceae', 'Annonaceae', 'Annonaceae', 'Eupomatiaceae', 'Magnoliaceae',
'Magnoliaceae', 'Myristicaceae', 'Aristolochiaceae', 'Aristolochiaceae', 'Piperaceae', 'Piperaceae',
'Saururaceae', 'Saururaceae', 'Acoraceae', 'Alismataceae', 'Araceae', 'Juncaginaceae', 'Posidoniaceae',
'Agapanthaceae', 'Agavaceae', 'Agavaceae', 'Agavaceae', 'Agavaceae', 'Agavaceae', 'Alliaceae', 'Alliaceae',
'Amaryllidaceae', 'Amaryllidaceae', 'Amaryllidaceae', 'Amaryllidaceae', 'Amaryllidaceae', 'Amaryllidaceae',
'Asparagaceae', 'Asparagaceae', 'Asparagaceae', 'Asparagaceae', 'Asphodelaceae', 'Boryaceae',
'Hemerocallidaceae', 'Hemerocallidaceae', 'Hemerocallidaceae', 'Hyacinthaceae', 'Hyacinthaceae',
'Hypoxidaceae', 'Iridaceae', 'Laxmanniaceae', 'Orchidaceae', 'Orchidaceae', 'Orchidaceae', 'Orchidaceae',
'Orchidaceae', 'Orchidaceae', 'Orchidaceae', 'Ruscaceae', 'Ruscaceae', 'Ruscaceae', 'Ruscaceae', 'Ruscaceae',
'Ruscaceae', 'Tecophilaeaceae', 'Tecophilaeaceae', 'Themidaceae', 'Xanthorrhoeaceae', 'Xeronemataceae',
'Dioscoreaceae', 'Colchicaceae', 'Colchicaceae', 'Colchicaceae', 'Melanthiaceae', 'Melanthiaceae',
'Smilacaceae', 'Cyclanthaceae', 'Pandanaceae', 'Stemonaceae', 'Velloziaceae', 'Velloziaceae', 'Arecaceae',
'Arecaceae', 'Arecaceae', 'Arecaceae', 'Arecaceae', 'Bromeliaceae', 'Cyperaceae', 'Cyperaceae', 'Cyperaceae',
'Joinvilleaceae', 'Juncaceae', 'Poaceae', 'Poaceae', 'Poaceae', 'Poaceae', 'Poaceae', 'Poaceae', 'Poaceae',
'Poaceae', 'Poaceae', 'Poaceae', 'Poaceae', 'Poaceae', 'Poaceae', 'Poaceae', 'Poaceae', 'Poaceae', 'Poaceae',
'Poaceae', 'Poaceae', 'Poaceae', 'Poaceae', 'Restionaceae', 'Typhaceae', 'Typhaceae', 'Cannaceae',
'Heliconiaceae', 'Lowiaceae', 'Marantaceae', 'Strelitziaceae', 'Zingiberaceae', 'Zingiberaceae']
# List of Species names for filtering
Species = ['Aextoxicon punctatum', 'Berberidopsis beckleri', 'Buxus sempervirens', 'Dillenia indica',
'Hibbertia grossulariifolia', 'Gunnera manicata', 'Nelumbo sp.', 'Platanus occidentalis',
'Grevillea robusta', 'Hakea drupacea', 'Hakea prostrata', 'Meliosma cuneifolia', 'Nandina domestica',
'Podophyllum peltatum', 'Euptelea pleiosperma', 'Hypecoum procumbens', 'Akebia trifoliata',
'Cocculus laurifolius', 'Argemone mexicana', 'Capnoides sempervirens', 'Ceratocapnos vesicaria',
'Chelidonium majus', 'Corydalis linstowiana', 'Eschscholzia californica', 'Papaver bracteatum',
'Papaver rhoeas', 'Papaver setigerum', 'Papaver somniferum', 'Sanguinaria canadensis', 'Anemone hupehensis',
'Anemone pulsatilla', 'Aquilegia coerulea', 'Cimicifuga racemosa', 'Hydrastis canadensis',
'Thalictrum thalictroides', 'Trochodendron aralioides', 'Amborella trichopoda', 'Amborella trichopoda',
'Austrobaileya scandens', 'Illicium floridanum', 'Illicium parviflorum', 'Kadsura heteroclita',
'Ceratophyllum demersum', 'Nuphar advena', 'Nymphaea sp.', 'Ascarina rubricaulis', 'Sarcandra glabra',
'Cypselea humifusa', 'Delosperma echinatum', 'Sesuvium portulacastrum', 'Sesuvium verrucosum',
'Trianthema portulacastrum', 'Zaleya pentandra', 'Aerva lanata', 'Aerva persica', 'Alternanthera brasiliana',
'Alternanthera caracasana', 'Alternanthera sessilis', 'Alternanthera tenella', 'Amaranthus cruentus',
'Amaranthus retroflexus', 'Beta maritima', 'Blutaparon vermiculare', 'Chenopodium quinoa', 'Kochia scoparia',
'Basella alba', 'Lophophora williamsii', 'Opuntia polyacantha', 'Pereskia aculeata', 'Dianthus caryophyllus',
'Polycarpaea repens', 'Saponaria officinalis', 'Schiedea membranacea', 'Silene latifolia',
'Spergularia media', 'Atriplex hortensis', 'Atriplex prostrata', 'Atriplex rosea', 'Frankenia laevis',
'Microtea debilis', 'Mollugo cerviana', 'Mollugo nudicaulis', 'Mollugo verticillata', 'Nepenthes alata',
'Allionia incarnata', 'Allionia incarnata', 'Allionia incarnata', 'Boerhavia coccinea', 'Boerhavia dominii',
'Bougainvillea spectabilis', 'Mirabilis jalapa', 'Petiveria alliacea', 'Physena madagascariensis',
'Hilleria latifolia', 'Phytolacca americana', 'Phytolacca bogotensis', 'Limonium spectabile',
'Plumbago auriculata', 'Polygonum convolvulus', 'Portulaca amilis', 'Portulaca cryptopetala',
'Portulaca grandiflora', 'Portulaca molokiniensis', 'Portulaca oleracea', 'Portulaca pilosa',
'Portulaca suffruticosa', 'Portulaca umbraticola', 'Portulaca umbraticola', 'Sarcobatus vermiculatus',
'Simmondsia chinensis', 'Talinum sp.', 'Tamarix chinensis', 'Balanophora fungosa', 'Dendropemon caribaeus',
'Ximenia americana', 'Daenikera sp.', 'Exocarpos cupressiformis', 'Santalum acuminatum',
'Phoradendron serotinum', 'Liquidambar styraciflua', 'Aphanopetalum resinosum', 'Cercidiphyllum japonicum',
'Crassula perforata', 'Kalanchoe crenato-diagremontiana', 'Rhodiola rosea', 'Daphniphyllum macropodum',
'Ribes aff. giraldii', 'Myriophyllum aquaticum', 'Hamamelis virginiana', 'Loropetalum chinense',
'Loropetalum chinense', 'Loropetalum chinense', 'Itea virginica', 'Paeonia lactiflora', 'Astilbe chinensis',
'Bergenia sp.', 'Boykinia jamesii', 'Heuchera sanguinea', 'Mitella pentandra', 'Oresitrophe rupifraga',
'Peltoboykinia watanabei', 'Saxifraga stolonifera', 'Tellima breviflora', 'Tiarella polyphylla',
'Angelica archangelica', 'Heracleum lanatum', 'Hedera helix', 'Hydrocotyle umbellata', 'Polyscias fruticosa',
'Griselinia littoralis', 'Griselinia racemosa', 'Centella asiatica', 'Myodocarpus sp.',
'Pennantia corymbosa', 'Pittosporum resiniferum', 'Pittosporum sahnianum', 'Ilex paraguariensis',
'Ilex sp.', 'Ilex vomitoria', 'Helwingia japonica', 'Corokia cotoneaster', 'Anthemis tinctoria',
'Aster tataricus', 'Carthamus lanatus', 'Cicerbita plumieri', 'Conyza canadensis', 'Erigeron canadensis',
'Flaveria angustifolia', 'Flaveria bidentis', 'Flaveria brownii', 'Flaveria cronquistii',
'Flaveria kochiana', 'Flaveria palmeri', 'Flaveria pringlei', 'Flaveria pubescens', 'Flaveria sonorensis',
'Flaveria trinervia', 'Flaveria vaginata', 'Helenium autumnale', 'Inula helenium', 'Lactuca graminifolia',
'Leontopodium alpinum', 'Matricaria matricarioides', 'Senecio rowleyanus', 'Silybum marianum',
'Solidago canadensis', 'Tanacetum parthenium', 'Tragopogon castellanus', 'Tragopogon dubius',
'Tragopogon porrifolius', 'Tragopogon pratensis', 'Xanthium strumarium', 'Lobelia siphilitica',
'Platycodon grandiflorus', 'Scaevola mossambicensis', 'Menyanthes trifoliata', 'Phelline lucida',
'Stylidium adnatum', 'Ehretia acuminata', 'Heliotropium calcicola', 'Heliotropium convolvulaceum',
'Heliotropium filiforme', 'Heliotropium greggii', 'Heliotropium karwinskyi', 'Heliotropium mendocinum',
'Heliotropium racemosum', 'Heliotropium tenellum', 'Heliotropium tenuifolium', 'Heliotropium texanum',
'Lennoa madreporoides', 'Mertensia paniculata', 'Phacelia campanularia', 'Pholisma arenarium',
'Alangium chinense', 'Cornus florida', 'Curtisia dentata', 'Deutzia scabra', 'Dichroa febrifuga',
'Hydrangea quercifolia', 'Philadelphus inodorus', 'Caiophora chuquitensis', 'Camptotheca acuminata',
'Nyssa ogeche', 'Sambucus canadensis', 'Viburnum odoratissimum', 'Lonicera japonica', 'Symphoricarpos sp.',
'Valeriana officinalis', 'Dipsacus asper', 'Actinidia chinensis', 'Impatiens balsamifera',
'Cyrilla racemiflora', 'Galax urceolata', 'Galax urceolata', 'Galax urceolata', 'Diospyros malabarica',
'Cavendishia cuatrecasasii', 'Ledum palustre', 'Monotropa uniflora', 'Rhododendron scopulorum',
'Sarcodes sanguinea', 'Fouquieria macdougalii', 'Maesa lanceolata', 'Souroubea exauriculata',
'Ardisia humilis', 'Ardisia revoluta', 'Ternstroemia gymnanthera', 'Phlox drummondii', 'Phlox sp.',
'Roridula gorgonias', 'Manilkara zapota', 'Sideroxylon reclinatum', 'Synsepalum dulcificum',
'Sinojackia xylocarpa', 'Symplocos tinctoria', 'Jacquinia sp.', 'Escallonia rubra',
'Platyspermation crassifolium', 'Eucommia ulmoides', 'Aucuba japonica', 'Allamanda cathartica',
'Apocynum androsaemifolium', 'Apocynum androsaemifolium', 'Asclepias curassavica', 'Asclepias syriaca',
'Catharanthus roseus', 'Holarrhena pubescens', 'Rauvolfia tetraphylla', 'Wrightia natalensis',
'Gelsemium sempervirens', 'Exacum affine', 'Gentiana acaulis', 'Strychnos spinosa', 'Galium boreale',
'Morinda citrifolia', 'Psychotria ipecacuanha', 'Psychotria marginata', 'Pyrenacantha malvifolia',
'Oncotheca balansae', 'Anisacanthus quadrifidus', 'Ruellia brittoniana', 'Sanchezia sp.',
'Strobilanthes dyeriana', 'Kigelia africana', 'Mansoa alliacea', 'Tabebuia umbellata', 'Byblis gigantea',
'Calceolaria pinifolia', 'Saintpaulia ionantha', 'Sinningia tuberosa', 'Agastache rugosa', 'Ajuga reptans',
'Lavandula angustifolia', 'Leonurus japonicus', 'Marrubium vulgare', 'Melissa officinalis',
'Micromeria fruticosa', 'Nepeta cataria', 'Oxera neriifolia', 'Oxera pulchella', 'Pogostemon sp.',
'Poliomintha bustamanta', 'Prunella vulgaris', 'Pycnanthemum tenuifolium', 'Rosmarinus officinalis',
'Salvia spp.', 'Scutellaria montana', 'Solenostemon scutellarioides', 'Teucrium chamaedrys',
'Thymus vulgaris', 'Vitex agnus-castus', 'Pinguicula agnata', 'Pinguicula caudata', 'Utricularia sp.',
'Chionanthus retusus', 'Forestiera segregata', 'Ligustrum sinense', 'Olea europaea', 'Conopholis americana',
'Epifagus virginiana', 'Lindenbergia philippensis', 'Orobanche fasciculata', 'Paulownia fargesii',
'Uncarina grandidieri', 'Erythranthe guttata', 'Antirrhinum majus', 'Bacopa caroliniana',
'Digitalis purpurea', 'Plantago maritima', 'Plantago virginica', 'Rehmannia glutinosa',
'Schlegelia parasitica', 'Schlegelia violacea', 'Anticharis glandulosa', 'Buddleja lindleyana',
'Buddleja sp.', 'Celsia arcturus', 'Verbascum sp.', 'Polypremum procumbens', 'Lantana camara',
'Phyla dulcis', 'Verbena hastata', 'Convolvulus arvensis', 'Cuscuta pentagona', 'Ipomoea coccinea',
'Ipomoea hederacea', 'Ipomoea indica', 'Ipomoea lindheimeri', 'Ipomoea lobata', 'Ipomoea nil',
'Ipomoea pubescens', 'Ipomoea purpurea', 'Ipomoea purpurea', 'Ipomoea quamoclit',
'Kaliphora madagascariensis', 'Atropa belladonna', 'Brugmansia sanguinea', 'Datura metel', 'Lycium barbarum',
'Lycium sp.', 'Lycopersicon cheesmanii', 'Nicotiana sylvestris', 'Solanum dulcamara', 'Solanum lasiophyllum',
'Solanum lycopersicum', 'Solanum ptychanthum', 'Solanum sisymbriifolium', 'Solanum xanthocarpum',
'Akania lucens', 'Batis maritima', 'Arabidopsis thaliana', 'Arabis alpina', 'Brassica nigra',
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'Draba ossetica', 'Draba sachalinensis', 'Sinapis alba', 'Carica papaya', 'Cleome gynandra',
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'Moringa oleifera', 'Reseda odorata', 'Salvadora sp.', 'Tropaeolum peregrinum', 'Crossopetalum rhacoma',
'Stackhousia spathulata', 'Stachyurus praecox', 'Staphylea trifolia', 'Pilostyles thurberi', 'Begonia sp.',
'Coriaria nepalensis', 'Thladiantha villosula', 'Acacia pycnantha', 'Apios americana',
'Astragalus membranaceus', 'Astragalus propinquus', 'Bauhinia tomentosa', 'Bituminaria bituminosa',
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'Mammea americana', 'Chrysobalanus icaco', 'Licania michauxii', 'Garcinia livingstonei',
'Garcinia oblongifolia', 'Erythroxylum coca', 'Croton tiglium', 'Euphorbia mesembryanthemifolia',
'Euphorbia pekinensis', 'Manihot esculenta', 'Manihot grahamii', 'Ricinus communis', 'Hypericum perforatum',
'Linum bienne', 'Linum grandiflorum', 'Linum hirsutum', 'Linum leonii', 'Linum lewisii', 'Linum macraei',
'Linum perenne', 'Linum strictum', 'Linum usitatissimum', 'Malesherbia fasciculata', 'Galphimia gracilis',
'Ochna mossambicensis', 'Ochna serrulata', 'Passiflora caerulea', 'Passiflora edulis', 'Bischofia javanica',
'Phyllanthus sp.', 'Drypetes deplanchei', 'Rhizophora mangle', 'Populus trichocarpa', 'Salix acutifolia',
'Salix dasyclados', 'Salix eriocephala', 'Salix fargesii', 'Salix purpurea', 'Salix sachalinensis',
'Salix viminalis', 'Viola canadensis', 'Viola tricolor', 'Bixa orellana', 'Cistus inflatus',
'Dombeya burgessiae', 'Hibiscus cannabinus', 'Hoheria angustifolia', 'Theobroma cacao', 'Muntingia calabura',
'Schizolaena sp.', 'Daphne giraldii', 'Edgeworthia papyrifera', 'Wikstroemia indica',
'Terminalia neotaliala', 'Gyrostemon ramulosus', 'Heteropyxis natalensis', 'Lagerstroemia indica',
'Punica granatum', 'Medinilla magnifica', 'Tetrazygia bicolor', 'Eucalyptus gracilis',
'Eucalyptus leucoxylon', 'Melaleuca quinquenervia', 'Syzygium micranthum', 'Syzygium paniculatum',
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'Oenothera elata hookeri', 'Oenothera filiformis', 'Oenothera gaura', 'Oenothera grandiflora',
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'Melia azedarach', 'Peganum harmala', 'Citrus x paradisi', 'Phellodendron amurense', 'Acer negundo',
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'Michelia maudiae', 'Myristica fragrans', 'Aristolochia elegans', 'Saruma henryi', 'Peperomia fraseri',
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'Allium commutatum', 'Allium sativum', 'Amaryllis belladonna', 'Narcissus viridiflorus',
'Phycella aff. cyrtanthoides', 'Rhodophiala pratensis', 'Traubia modesta', 'Zephyranthes treatiae',
'Asparagus densiflorus', 'Disporopsis pernyi', 'Maianthemum canadense', 'Maianthemum sp.', 'Aloe vera',
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'Urginea maritima', 'Curculigo sp.', 'Sisyrinchium angustifolium', 'Lomandra longifolia', 'Drakaea elastica',
'Goodyera pubescens', 'Haemaria discolor', 'Masdevallia yuangensis', 'Oncidium sphacelatum',
'Platanthera clavellata', 'Vanilla planifolia', 'Eriospermum lancifolia', 'Nolina atopocarpa',
'Nolina bigelovii', 'Peliosanthes minor', 'Ruscus sp.', 'Sansevieria trifasciata', 'Cyanastrum cordifolium',
'Cyanella orchidiformis', 'Brodiaea sierrae', 'Johnsonia pubescens', 'Xeronema callistemon',
'Dioscorea villosa', 'Colchicum autumnale', 'Colchicum autumnale', 'Gloriosa superba', 'Helonias bullata',
'Xerophyllum asphodeloides', 'Smilax bona-nox', 'Ludovia sp.', 'Freycinetia multiflora', 'Stemona tuberosa',
'Talbotia elegans', 'Xerophyta villosa', 'Cocos nucifera', 'Nypa fruticans', 'Sabal bermudana',
'Serenoa repens', 'Typhonium blumei', 'Brocchinia reducta', 'Cyperus papyrus', 'Lepidosperma gibsonii',
'Mapania palustris', 'Joinvillea ascendens', 'Juncus inflexus', 'Aristida stricta', 'Avena fatua',
'Cymbopogon nardus', 'Deschampsia cespitosa', 'Eleusine coracana', 'Microstegium vimineum',
'Neurachne alopecuroidea', 'Neurachne annularis', 'Neurachne lanigera', 'Neurachne minor',
'Neurachne munroi', 'Neurachne tenuifolia', 'Orysa sativa', 'Panicum miliaceum', 'Paraneurachne muelleri',
'Sorghum bicolor', 'Thyridolepis mitchelliana', 'Thyridolepis multiculmis', 'Triodia aff. bynoei',
'Uniola paniculata', 'Uniola paniculata', 'Chondropetalum tectorum', 'Typha angustifolia', 'Typha latifolia',
'Canna sp.', 'Heliconia sp.', 'Orchidantha maxillarioides', 'Maranta leuconeura', 'Strelitzia reginae',
'Curcuma longa', 'Zingiber officinale']
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